В 1476 году крепость отражает нападение войск турецкого султана Мухаммеда Второго. На рубеже 15 и 16 веков Молдавское княжество вместе с Хотином попадает в вассальную зависимость от Турции, разместившую в крепости военный гарнизон.

       В 1538 году город штурмом берут польские войска, возглавляемые Яном Тарновским. Осаждающие взрывают подкопы под крепостью, разрушают три башни и часть западной стены. Хотин на какое-то время остается у поляков и в 1540 - 1544 годах они возобновляют постройки, разрушенные во время штурма 1538 года. В 1563 году князь Дмитрий Вишневецкий во главе отряда из 500 запорожских казаков захватывает цитадель, и какое-то время её удерживает…

        18 веке хотинскую карту разыгрывают две империи - все та же Османская и Российская, на рубеже веков к игрокам присоединяется Австро-Венгрия.

       После ряда побед над османской армией к Хотину подходит русская армия под командованием генерал-фельдмаршала Бурхарда Христофора фон Миниха. 19 сентября 1739 года комендант турецкого гарнизона паша Илияс Колчак без боя сдает крепость и передает Миниху ключи от города… Но по Белградскому мирному договору 29 сентября 1739 года российские войска покидают город.

       Российская армия занимала Хотин в 1769 - 1774, 1787 - 1791 и 1806 годах. Какое-то время город входил в состав Австро-Венгрии, но в 1793 году был возвращен Турции.